Desenvolvimento de pagamentos e cobranças por boleto bancário.

Estou precisando desenvolver um sistema web de controle de pagamentos e cobranças via boleto bancário, de modo que meus clientes possa emitir cobranças via boleto bancário a terceiros e possam controlar as faturas pagas e não pagas dentro de seu próprio painel, e nós como administradores do sistema saibamos também quais as faturas que foram pagas ou não, (Hoje usamos um controle de cobrança praticamente manual). Além de outras funções é claro que serão explicadas melhor no decorrer do projeto. Sobre o pagamento podemos ir acertando por etapas cumpridas ou horas trabalhadas no mesmo, quanto a isso é tranquilo! A parte HTML (Estrutural, Layout) já tenho a ideia (Template pronto).